获奖名称	获奖类别及等级	完成人	获奖时间
中华医学科技奖	中华医学会 一等	陈国强
明治乳业生命科学奖(科学奖)	日本明治乳业株式会社和国家人类基因组南方研究中心 科学奖	金 健	2008
何梁何利基金科学与技术进步奖	何梁何利基金	段树民	2008
国家自然科学奖	国家 二等	张永莲、陈小章、刘强、胡远新、李鹏	2008
上海市自然科学奖	上海市 二等	王恩多、陈剑峰、杜兴、赵明炜、郝睿	2008
上海市自然科学奖	上海市 二等	黄勇平、苗雪霞、徐世杰、李明辉、王升跃	2008
上海市自然科学奖	上海市 二等	李亦学、钟扬、曾嵘、曹志伟、赵国屏	2008
上海市自然科学奖	上海市 二等	吉永华、陈谨、张旭英、刘通、赵荣	2008
上海市自然科学奖	上海市 一等	陈国强、吴英理、卢莹、赵克温、刘玮	2008
上海市自然科学奖	上海市 三等	朱鼎良、高平进、陈闻东、郭淑杰、李燕	2008
上海市科技进步奖	上海市 一等	黄丹枫、吕恬生、 薛万新、余纪柱、 陈金星、丁　明、钱海忠、 牛庆良、 申广荣、王培宏、王淑琴、 张红梅、蔡向忠、汪　军、 潘静娴	2008
上海市科技进步奖	上海市 三等	乐卫东、陈晟、杜芸兰、李旭平、李靓、杨德华、张晓洁	2008
明治乳业生命科学奖(杰出奖)	日本明治乳业株式会社和国家人类基因组南方研究中心 杰出奖	戈宝学	2008
明治乳业生命科学奖(科学奖)	日本明治乳业株式会社和国家人类基因组南方研究中心 科学奖	刘小龙	2008
明治乳业生命科学奖(优秀奖)	日本明治乳业株式会社和国家人类基因组南方研究中心 优秀奖	王晓明	2008
明治乳业生命科学奖(科学奖)	日本明治乳业株式会社和国家人类基因组南方研究中心 科学奖	王二涛	2008
何梁何利基金科学与技术进步奖	何梁何利基金	陈晓亚	2008
国家自然科学奖	国家 二等	韩斌，冯旗，张玉军，王升跃，薛勇彪	2007
国家自然科学奖	国家 二等	裴钢，马兰，高华，程智洁，荆清	2007
中华人民共和国国际科学技术合作奖	国家	彼得·格鲁斯	2007