序号	项目名称	项目负责人员	合作单位	起始年限
1	共同研发神经疾病、糖尿病和癌症治疗领域的创新药物	上海生科院吴家睿研究员	法国赛诺菲安万特公司	2008
2	微生物发酵法生产丁醇技术的合作研究及产业化开发	植物生理生态研究所杨晟研究员	英国绿色生物制剂（Green Biologics）公司	2008
3	酒精对青少年和孕妇的影响	营养科学研究所谢东研究员	法国保乐力加集团所属保乐力加（中国）公司	2008
4	混合型酒精饮品对人体的影响	营养科学研究所谢东研究员	法国保乐力加集团所属保乐力加（中国）公司	2008
5	食源性病原体分子检测方法的研究开发	营养科学研究所王慧研究员	德国快而精（Qiagen）公司	2008
6	营养、肠道菌群与肥胖机理的病例-对照研究	营养科学研究所林旭研究员	法国农业科学院	2008
7	等节跳科(弹尾纲)种类鉴定和系统分类研究	植物生理生态研究所栾云霞副研究员	俄罗斯莫斯科国立师范大学	2008
8	“糖尿病系统生物学”创新团队国际合作伙伴计划	中国科学院系统生物学重点实验室吴家睿研究员	美国德克萨斯州立大学、加利福尼亚州伯明翰医学院路易斯安娜州立大学、密歇根大学、路易斯维尔大学	2008
9	Est3 蛋白在酵母端粒复制中的作用	生化细胞所周金秋研究员	俄罗斯莫斯科大学	2008
10	胚胎干细胞定向诱导神经分化治疗阿尔茨海默症过程中的JNK信号通路分子机制	生化细胞所景乃禾研究员	美国芝加哥大学	2008
11	Wnt信号转导途径的蛋白质相互作用网络	生化细胞所李林研究员	美国耶鲁大学	2008
12	天冬氨酰tRNA合成酶抑制剂复合物结构功能研究：一代新型抗生素设计	生化细胞所金由辛研究员	加拿大拉瓦尔大学	2008
13	NF-kB 调控的组织因子表达在深静脉血栓发生中的作用研究	生化细胞所耿建国研究员	加拿大多伦多大学	2008
14	大鼠副皋特异蛋白16（ELP16）的三级结构与功能研究	生化细胞所金由辛研究员	加拿大拉瓦尔大学	2008
15	Systematic Analysis of ncRNAs in Human Brain and Aging	计算生物学研究所Philip Khaiptovich研究员	美国阿拉斯加大学	2007
16	Hibernation proteomic project	计算生物学研究所严军研究员	美国阿拉斯加大学	2007
17	国家基金委与加拿大魁北克医学基金会免疫学专题交流	生化细胞研究所耿建国研究员	加拿大魁北克医学研究基金会	2007
18	Study of steroid-converting enzymes, the members of the 17 beta-hydroxysteroid dehydrogenases (17 beta-HSDs)	生化细胞研究所林胜祥客座研究员	加拿大CHUQ医学研究中心	2007
19	Epididymis-Specific Proteins For Male Contraception	生化细胞研究所张永莲研究员	美国国立卫生研究院（NIH）	2007
20	Est3 蛋白在酵母端粒复制中的作用	生化细胞研究所周金秋研究员	莫斯科大学	2007
21	西方膳食对中国人肠道菌群和人体代谢的影响研究	植生生态研究所赵国屏研究员	法国农业科学研究院	2007
22	大白菜抗热基因鉴定	植生生态研究所何玉科研究员	荷兰科因(Keygene)公司	2007
23	中国禽流感病毒株RNA聚合酶和NS1抑制IFN产生的致病机制研究	上海巴斯德研究所孙兵研究员	德国弗赖堡病毒所	2007
24	神经元中G蛋白偶联受体转运机理研究	神经科学研究所张旭研究员	瑞典卡罗林斯卡医学院	2007
25	研究多巴胺和五羟色胺在多模态感觉通讯中所起的作用	神经科学研究所郭爱克研究员	法国勃艮大学	2007
26	哺乳动物流感病毒感染的呼吸道固有免疫研究	上海巴斯德所孙兵研究员	欧盟合作项目	2006
27	环境宿主和系统中流感病毒抗性研究	上海巴斯德所杜文圣研究员	欧盟合作项目	2006
28	衰老和线粒体损伤研究	营养所刘健康研究员	瑞士DSM公司	2006
29	应用系统生物学理念和方法研究抗癌药物的协同性治疗	健康所张济研究员	英国伦敦癌症研究所	2006
30	来自古老细菌超嗜热菌（Aquifex aeolicus）亮氨酰-tRNA合成酶研究	生化细胞所王恩多研究员	法国国家科学研究中心（CNRS）	2006
31	豌豆根瘤菌中基因调控的研究	生化细胞所洪国藩研究员	英国John Innes Centre	2006
32	附睾特异表达的抗菌肽Bin1b通过与精子SGG结合而保护精子免受细菌的攻击	生化细胞所张永莲研究员	加拿大Ottawa 健康研究所	2006
33	信号转导通路的分子机制研究	生化细胞所朱学良研究员	美国芝加哥大学，耶鲁大学，华盛顿康奈基研究所等	2006
34	干细胞定向分化的机理研究	生化细胞所景乃禾研究员	澳大利亚Monash大学	2006
35	应用小RNA技术研究基因功能	生化细胞所金由辛研究员	俄罗斯莫斯科大学	2006
36	胶质细胞源性神经营养因子(GDNF)信号通路的结构生物学与生物功能的研究	生化细胞所周嘉伟研究员	芬兰赫尔辛基大学	2006
37	混合菌群产氢系统分子监控关键技术的研究	植生生态所周志华研究员	美国加州大学伯克利分校	2006
38	芸苔属作物分子育种	植生生态所何玉科研究员	荷兰科因(Keygene)公司	2006
39	水稻种子发育的代谢组学研究	植生生态所薛红卫研究员	德国马普分子植物生理学研究所	2006